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1、技術介紹
轉(zhuǎn)錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。通過轉(zhuǎn)錄組測序,能夠全面獲得物種特定組織或器官的轉(zhuǎn)錄本信息,從而進行轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)研究、變異研究、基因表達水平研究以及全新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn)等研究。
我公司提供的轉(zhuǎn)錄組測序服務有:
1) 有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組測序
2) 鏈特異性轉(zhuǎn)錄組測序
3) lncRNA測序
4) 環(huán)狀RNA測序
5) small RNA測序
6) 新物種de novo 轉(zhuǎn)錄組測序
7) 新物種均一化cDNA文庫轉(zhuǎn)錄組測序
有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組測序
這里的轉(zhuǎn)錄組測序指狹義的mRNA測序。mRNA測序是轉(zhuǎn)錄組測序中非常重要的內(nèi)容,可以真實的反映基因的表達調(diào)控信息。晶能生物可以提供各類真核和原核物種的mRNA測序服務,通過測序可以快速獲得完整的mRNA信息,從而進行各類相關研究。
技術優(yōu)勢:
1) 保真性好:可以更加真實的反映基因表達信息,方便進行基因差異表達、新基因發(fā)現(xiàn)等研究;
2) 可靠性強:高數(shù)據(jù)量保證不同豐度的轉(zhuǎn)錄本都能準確定量。
2、技術路線
3、樣品要求
1)樣品類型:細胞、新鮮組織或RNA樣品。
2)樣品的量:細胞樣品請?zhí)峁┲辽?×107個細胞,組織樣品請?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片,RNA樣品請?zhí)峁? μg以上的總RNA。
3)樣品質(zhì)量:RNA無明顯降解,提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間,濃度 ≥
500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。
4)樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80℃保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存。樣品保存期間避免反復凍融。
5)樣品運輸:樣品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。